肠易激综合征（irritablebowelsyndrome，IBS）是一组持续或间歇发作，以腹痛、腹胀、排便习惯和（或）大便性状改变为临床表现，但消化系统结构是正常的。因IBS与IBD发病初期症状类似，因此仅以临床表现很难区别，内镜检查可以帮助明确功能性或器质性疾病，这无疑增加了患者的痛苦和医疗费用。临床表明，绝大多数经历内镜检查的患者，实际上并未有严重的病变，因此慢性腹部不适的患者在就诊初期没有必要进行内镜检查。
粪便中的炎症标志物粪钙卫蛋白（FCP）的检查对IBD和IBS的鉴别诊断极为有用。粪便标志物对于诊断IBD具有较高的敏感性，且检测物方便获得。FCP还可以反映IBD患者的肠道黏膜炎症状况，在一定程度上可以避免内镜检查及检查次数，减少患者痛苦。国外的研究结果表明，FCP鉴别诊断成人IBD和IBS时，敏感性和特异性均在80%左右。另有研究报道，在儿童患者中，检测FCP用于鉴别诊断IBD和IBS，也同样敏感，并且最大程度的减轻了儿童患者接受内镜检查的痛苦。另外在IBD的缓解期，检测粪便钙卫蛋白同样可以反映炎症程度，监测用药反应，因此可以避免多次进行内镜检查。