肠易激综合征(IBS)是一类功能性肠病，发病年龄多见于20~50岁，常与其他胃肠紊乱疾病并发。主要症状：局限性或弥漫性腹痛或腹部不适、腹泻、腹胀、上胃肠道症状、肠外症状等。
大量研究表明，IBS的发生可能涉及多种因素，包括肠道动力异常、内脏高敏感性、脑-肠轴功能失调、肠道感染、免疫系统激活、肠道菌群失调、精神心理障碍等。
目前，已有很多的相关研究表明，肠道菌群失调是导致肠易激综合征发病的主要原因之一。因此，恢复正常肠道菌群对于改善肠易激综合征可能是一个有效的治疗途径。且研究表明粪菌移植（FMT）对肠道菌群紊乱有益。
粪菌移植（FMT）是将健康人粪便中的功能菌群，移植到患者胃肠道内，重建新的肠道菌群，实现肠道及肠道外疾病的治疗。其主要作用机理可能是利用粪便中有益菌种的生态占位，定植抗力，生物夺氧，免疫调节，降低肠腔pH值和细菌代谢产物的营养等。
FMT的移植的粪便中最重要的是常年栖息于肠道内的数以亿计的微生物，它们和肠道上皮细胞等生物成分与食源性非生物成分（未被消化的食物）及来自胃、肠、胰和肝的分泌物（如激素、酶、黏液和胆盐等）共同构成肠道微生态系统，重建正常的肠道微生态结构。
挪威卑尔根大学的MagdyEl-Salhy博士及其同事进行了一项随机双盲安慰剂对照试验，观察名中度至重度IBS患者接受粪菌移植三个月后的临床疗效。FMT治疗组的患者接受1名健康男性捐献者的粪便，该捐献者需无吸烟史、近期未服用任何药物且营养不良指数（DI）为1。试验的主要终点为IBS症状积分量表总评分（0-）至少降低50分。结果显示，接受30g和60g的粪菌移植患者中有76.9％和89.1％的患者达到了主要终点指标，而安慰剂组仅23.6％达到主要终点指标（P0.）。
腹泻型、便秘型和混合型的IBS患者的总评分改善情况相似。FMT组和安慰剂组之间的次要终点指标（营养不良指数，DI）的变化无显著差异，但FMT组患者移植后的肠道菌群中双歧杆菌、乳杆菌和阿利培斯菌水平较高，拟杆菌属水平较低。与安慰剂组相比，FMT组的患者在腹部症状、疲劳和生活质量方面有显著改善。
研究人员总结说：“FMT对肠易激综合征患者是一种有效的治疗方法。”“对粪菌群移植的反应随剂量而增加。”
粪菌移植多久有效果？
一般情况下，粪菌移植之后1-2个礼拜左右，患者的症状可以得到一定改善，也有的患者做完一个月以后才开始出现症状缓解，跟菌群在患者体内定植的时间以及定植程度有关系。一般情况下粪菌移植的疗效有部分病人可以持续的时间比较长。