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收集、整理：刘士广
校对、审核：百家争鸣虫虫特工队
综述
众所周知，人芽囊原虫(Blastocystishominis)分布于世界各地，全球约有10亿人感染，几乎是全球范围内感染率最高的肠道寄生性原虫。
芽囊原虫分类的历史十分复杂。该虫最早被描述为一种酵母、真菌、其它原生动物的包囊或退化细胞。基于形态和生理特征，Zierdt等将芽囊原虫归为孢子虫，最后重新归类为肉足(亚门)原虫。
直到年，Silberman等根据其完整的SSU-rRNA基因序列和系统发育分析才最终将其归在不等鞭藻类(Stramenopiles)。年Arisue等对其SSU-rRNA、胞浆型70kDa热休克蛋白、翻译延伸因子2和空泡ATP酶的非催化的B亚单位等基因序列进行综合分析，确认了这种分类。最近研究发现不等鞭藻类与囊泡虫类(Alveolates)和有孔虫类(Rhizaria)关系密切，有共同的起源，所以3个类群合并称为SAR超类群，是原生生物的一个主要类群。因为芽囊原虫无鞭毛，无运动性，不具有不等鞭藻类的典型特征，是不等鞭藻类中的一个例外，这在一定程度上解释了为什么鉴定其正确的分类关系需要这么长时间。
流行病学调查发现免疫受损和卫生条件差、食用污染的食物和水的人群更容易感染。在我国，不同地域的感染率大致范围为1.9%-32.1%，其差异可能与所调查对象的来源及其生活环境、卫生条件和生活习惯等因素有关，也可能是因为诊断方法的不同以及除空泡型外的其他形态鉴别困难所致。近年来，对不同地域人群感染的芽囊原虫亚型(subtype，ST)及其分布频率进行了研究。目前已知人感染9种芽囊原虫ST(ST1-ST9)，其中ST1-ST4占所有调查的人源芽囊原虫ST的90%以上。我国感染率最高的为ST3(64.9%)，其次分别为ST1(29.5%)、ST2(0.65%)、ST4(0.65%)。也有一些存在混合亚型感染，感染率为1.1%～14.3%。
芽囊原虫也广泛存在于犬科动物、猪、灵长类、鸟类以及啮齿类动物体内。通常认为芽囊原虫是人畜共患寄生虫，且通过粪-口途径传播。因而应当防止动物粪便污染水源、食物和环境。
年10月CDC网站(