首都医科医院消化分中心以食管、胃肠及肝胆胰腺疾病的内镜介入(微创)诊断与治疗为特色，国内领先、国际知名。
是国家消化系统疾病临床医学研究中心、国家重点临床专科、北京市消化疾病中心。由消化一、二、三科、消化内镜中心（全球20家最卓越之一）和消化实验室组成，共有医生75人、科研人员10人、科研辅助人员10人、护士71人。
西城院区位于首都核心区（前门南、天坛西）；
通州院区位于北京城市副中心。